核技術應用研究中心前身“高技術研發中心”成立于2002年，是高能所內開展科技成果技術轉化的研究中心之一，是研究所先進加速器技術、先進射線技術和射線應用技術等優勢學科方向科技成果轉化的平臺。2012年整合為核技術應用研究中心。

　　核技術應用研究中心是高能所的創新研究單元之一,是研究所先進加速器技術、先進射線技術和射線應用技術等優勢學科方向科技成果轉化的平臺。中心以國家需求為導向,以成果轉化為目標,開展前沿技術研究、關鍵部件研制和應用系統開發中心依托高能所的創新性成果及技術積累，開展了核醫學成像、精密檢測與安全檢查應用加速器等領域的應用研究，開發了若干性能先進、具有市場競爭力的射線成像裝備、應用加速器設備。研制成功動物實驗研究用PET/CT、 SPECT/CT，乳腺專用PET、SPECT/CT，以及人體全身PET等核醫學影像設備；研制成功多型號核成像探測設備和多種類高分辨率三維顯微CT系統及中高能CT系統；研制了多種應用型加速器和關鍵部件，能根據用戶需求完成輻照加速器整機系統研制并提供系統解決方案。

　　中心建立了可持續發展的應用研究和對外開放服務為國內相關企事業單位提供科學研究及無損檢測服務，并釆取多種方式與地方、部委及企業合作，促進科技成果的轉移轉化。